学堂从创办起，就采用半日课堂半日操练制。为培养学生成为合格的军官，要坚持冬练三九、夏练三伏。特别是炎热的夏季，步炮工骑四科学生，要在滚烫的沙地上或汗水湿透的马背上摸爬滚打。军服虽早被汗水浸透，但未经教官允许也不准解开衣扣；口渴了未经允许也不准喝水。由于王余庆和弟弟们吃苦耐劳、认真训练，动作准确无误，曾多次受到教官队前嘉奖。
按学堂章程规定：速成学堂每期为两年。第二年毕业考试之前，要有半年的入伍实习阶段。王余庆和四个弟弟被分派到当时驻保定的北洋陆军中入伍实习。由于时间短，各项科目安排得非常紧凑，因而并不比课堂学习轻松。现将光绪三十二年（1906年）四月初九至十三，保定北洋陆军速成武备学堂入伍生军中实习日程记录摘录如下（原文存北京第一历史档案馆陆军部档，原文无标点）：
……四月初九星期五，晴，口令：经武，早操成队，教练午课，讲各种兵之性能，晚操野外演习前卫及前哨动作。灯课自习是夜。
四月十一，星期日，晴，口令：壁垒。午前检查武装，下午放假，灯课休息是夜。
四月十二，星期一，晴，口令：合济。是日因大风狂起休息一日是夜。
四月十三，星期二，晴，口令：屏番。早操全协演排，午课因天热改为休息。晚操全镇演排，灯课唱军歌是夜。
1906年秋，速成二期各兵科学生进行毕业考试。现将当时的部分试题摘录其中一节列下（原卷存在北京第一历史档案馆陆军部档）……各兵科统考分拟：历史题、物理题、几何题、数学题、代数题、战法题……。其中：
地形题：问白河水流的方向？
军器题：问直接瞄准和间接瞄准各器具的名称。
军制题：将步、马、炮、工、辎重各队一营及其编制列出。
卫生题：问预防传染病要领及在室内吐痰于身体有何害处？
上述考试由于科目繁多内容复杂，特别是一些兵科必须在野外进行，如骑兵、炮兵、工兵、辎重兵等，要采用近似实战式的考核。因此，用了十余天时间才考完。
王余庆和四个弟弟最后都以优异成绩通过了毕业考试。随后即进行了毕业分配：
五弟王麟庆被分派到奉天（今沈阳），先任奉天第一混成协排长，后升任队官、教练官、少校营长、八十团上校团长、绥远陆军混成团上校团长、绥远“剿匪”一支队支队长，授陆军少将衔。获四等文虎章、四等嘉禾章。
七弟王都庆被分配到北京任清廷禁卫军排长，后升任队官、军咨府一厅二科二等科员、陆军第二镇二等参谋、一等参谋。1907年冬又入保定军官学堂（陆大）第二期学习，1909年9月毕业后任陆军第六混成旅炮二团团长、二师三团团长、十三团团长、步兵八团团长、第一军司令部上校副军事参议、湖北陆军第二十一混成旅少将旅长、湖北暂编陆军第七师中将师长、北洋军鄂西第二路军总司令。获二等文虎章、四等嘉禾章，授植威将军和亮威将军。在紫禁城任职期间，曾几次拜见过西太后和光绪帝。在任队官期间，曾得到过西太后赏赐的小皮袄一件。
王余庆和二弟王凯庆、三弟王桐庆（又名王建飞）在征得本人同意后留学堂任职。王余庆任步兵科学兵长；王凯庆先任炮兵学长后任连长，1924年9月任江苏陆军第六师中将师长；王桐庆任步兵科学兵长，1924年任江西陆军混成旅少将旅长。和王余庆兄弟同期毕业的著名学生还有王承斌、齐燮元、刘汝贤、齐振林等将军。
1906年8月以后，北洋陆军速成武备学堂更名为陆军速成学堂，隶属清廷陆军部，又称通国陆军速成学堂或协和陆军速成学堂。学生来源由北洋各省扩大到全国，计划内“各年考收学生一千一百四十名”，主要“招收各省旗未毕业的武备学生及按先验格式考取文理清通良家子弟”（《军机处录副档》）。其各省分配名额如下：
京旗八十名；直隶、江苏、湖北、四川、广东各六十名；顺天、奉天、山东、河南、安徽、江西、浙江、福建、湖南、云南各四十名；山西、陕西、甘肃、广西、贵州、新疆、吉林、黑龙江各三十名；江宁、杭州、福州、荆州、成都、广州、绥远城、热河、察哈尔九处驻防各十名；密云、青州、西安三处驻防各八名；宁夏驻防六名；共计一千一百四十名。
学生入学后，分为两班。凡经考试，有普通学科程度者，归第一班，专学军事专科，一年半毕业；如普通学科未学完或完全未学者，归第二班，先学普通学科一年，再学军事专科一年半，共二年半毕业。学生毕业后，均入队实习三个月。陆军部还规定，以后各省选送留学生，必须从这些学生中选派，不得“另自选送，以昭画一”（《陆军速成学堂总则》）。除此之外，学堂还设有留学生预备班，留学生必须在此学习后，经考查合格，才能派遣出国。
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